最近の更新でisearchからmigemoれないことに気付いた。
git logでlogを漁ってみたら、b3fc7a3e763fb260cd932dc6aedbe7b4c810a73cでsearch-default-regexp-mode (cf. http://typeinf-memo.blogspot.com/2015/11/emacs-gitisearchmigemo.html)がsearch-default-modeにrenameされたとある。これにnilをbindするとmigemoが使えるようになる。
(setq search-default-mode nil)